Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CBFBQ13951 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms