Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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