Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms