Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms