Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms