Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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PRDM2Q13029 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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PRDM2Q13029 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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PRDM2Q13029 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRDM2Q13029 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRDM2Q13029 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PRDM2Q13029 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PRDM2Q13029 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PRDM2Q13029 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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