Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NFX1Q12986 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NFX1Q12986 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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