Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB40BQ12829 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB40BQ12829 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB40BQ12829 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB40BQ12829 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB40BQ12829 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB40BQ12829 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB40BQ12829 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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RAB40BQ12829 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB40BQ12829 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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