Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms