Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MCCD1P59942 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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