Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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CLDN9O95484 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLDN9O95484 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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CLDN9O95484 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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