Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SOBPA7XYQ1 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SOBPA7XYQ1 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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