Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDAP2Q9NXN4 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms