Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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