Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HADHQ16836 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HADHQ16836 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HADHQ16836 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HADHQ16836 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HADHQ16836 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HADHQ16836 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HADHQ16836 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
HADHQ16836 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HADHQ16836 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HADHQ16836 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HADHQ16836 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HADHQ16836 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HADHQ16836 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms