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| CDKN3 | Q16667 | AC008121.2-201 | ENST00000614647 | 523 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | C3orf79-201 | ENST00000623038 | 580 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | MIR622-201 | ENST00000638396 | 96 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | CHD9-213 | ENST00000564845 | 11504 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | LINC01416-201 | ENST00000563553 | 2310 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | AC011124.1-201 | ENST00000521221 | 1762 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | CCDC141-202 | ENST00000409284 | 6960 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AL158064.1-201 | ENST00000627044 | 2242 nt | TSL 4 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | OR6C75-201 | ENST00000343399 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | RNU6-560P-201 | ENST00000364007 | 108 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | Y_RNA.500-201 | ENST00000384466 | 111 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | MTATP6P27-201 | ENST00000416987 | 621 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | AC236972.1-201 | ENST00000433225 | 199 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | AL354977.1-201 | ENST00000438147 | 679 nt | TSL 5 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC025750.2-201 | ENST00000442609 | 450 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | HSPE1P28-201 | ENST00000443139 | 211 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AL050303.1-201 | ENST00000444356 | 458 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | C6orf10-204 | ENST00000447241 | 2148 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC140076.1-201 | ENST00000449897 | 361 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AL136097.1-201 | ENST00000456945 | 913 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | UBE2DNL-203 | ENST00000474922 | 222 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC093278.1-201 | ENST00000494700 | 600 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC020703.1-201 | ENST00000505051 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC097521.1-201 | ENST00000505488 | 567 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC105914.1-201 | ENST00000511798 | 226 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | SNORA64.4-201 | ENST00000516632 | 81 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | CA1-215 | ENST00000522389 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CDKN3 | Q16667 | AP003969.1-201 | ENST00000531846 | 400 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AP002404.1-201 | ENST00000532005 | 451 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC104002.1-201 | ENST00000557025 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | ZFAND6-208 | ENST00000558688 | 780 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | AC079411.1-201 | ENST00000565441 | 795 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| CDKN3 | Q16667 | MIR3186-201 | ENST00000577404 | 85 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |