Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDKN3Q16667 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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