Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FSCN1Q16658 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms