Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SGCBQ16585 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms