Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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