Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms