Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK4Q16099 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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