Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USF2Q15853 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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