Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEDD8Q15843 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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