Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ALX1Q15699 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.59□□□□□ -2
ALX1Q15699 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ALX1Q15699 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ALX1Q15699 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ALX1Q15699 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ALX1Q15699 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ALX1Q15699 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ALX1Q15699 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms