Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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