Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms