Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SMCO1Q147U7 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SMCO1Q147U7 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMCO1Q147U7 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SMCO1Q147U7 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SMCO1Q147U7 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SMCO1Q147U7 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SMCO1Q147U7 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SMCO1Q147U7 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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