Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms