Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDH18Q13634 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms