Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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