Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ATRQ13535 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ATRQ13535 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
ATRQ13535 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATRQ13535 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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