Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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