Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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TOP3AQ13472 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TOP3AQ13472 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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