Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MKRN4PQ13434 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms