Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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