Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATMQ13315 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATMQ13315 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ATMQ13315 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ATMQ13315 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms