Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ERCC8Q13216 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERCC8Q13216 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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