Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CALCOCO2Q13137 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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CALCOCO2Q13137 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CALCOCO2Q13137 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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