Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms