Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPREP23469 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTPREP23469 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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