Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM35Q9UPQ4 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM35Q9UPQ4 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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