Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms