Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMG1Q96Q15 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMG1Q96Q15 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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