Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ANKRD42Q8N9B4 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms