Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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