Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms