Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTL8BQ17RB0 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms