Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LY6EQ16553 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms