Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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