Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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DDB1Q16531 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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